Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTP0

Shcbp1l, Testicular spindle-associated protein SHCBP1L, mousemouse

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Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1lQ3TTP0 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms