Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

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Length 417 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms