Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Birc6-202ENSMUST00000180037 15768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Tmem88b-201ENSMUST00000097742 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Slc5a9-201ENSMUST00000102719 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Rfesd-201ENSMUST00000050997 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Adcy6-205ENSMUST00000228566 3707 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Ttll5-205ENSMUST00000110224 4647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Dcun1d2-202ENSMUST00000110838 2955 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 A1cf-201ENSMUST00000075838 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Peg10-203ENSMUST00000176551 6567 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Sptbn5-204ENSMUST00000156159 3625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Abcg1-201ENSMUST00000024829 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Erbb4-202ENSMUST00000121473 12037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Phf24-203ENSMUST00000107976 6538 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Armc8-202ENSMUST00000185524 2820 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Zfp324-201ENSMUST00000038701 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Mitf-201ENSMUST00000043628 1921 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 9330175E14Rik-201ENSMUST00000180445 4852 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Itga7-202ENSMUST00000218290 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Atp1a2-202ENSMUST00000097464 3186 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Tfdp1-204ENSMUST00000209885 2511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Gm45041-201ENSMUST00000207366 3108 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Rnh1-201ENSMUST00000106033 2091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Tardbp-206ENSMUST00000105702 6425 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Slc27a5-201ENSMUST00000032539 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Dcaf11-206ENSMUST00000128490 2660 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Svil-211ENSMUST00000143254 6594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Armcx3-203ENSMUST00000086884 3488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Pard3-201ENSMUST00000026921 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Olfr6-203ENSMUST00000213651 4457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Ank2-214ENSMUST00000182547 2428 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Col9a1-201ENSMUST00000054588 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Inpp5b-201ENSMUST00000094782 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Ntrk3-206ENSMUST00000195262 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Ano10-203ENSMUST00000214409 2384 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Phc1-203ENSMUST00000112600 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Kdm3a-202ENSMUST00000167220 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Ncapd3-202ENSMUST00000086198 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Svil-204ENSMUST00000127297 6243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Gm32742-201ENSMUST00000210433 8516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Celsr3-201ENSMUST00000024238 11547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 D030028A08Rik-202ENSMUST00000131501 3542 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Tceal8-204ENSMUST00000163584 2358 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms