Protein–RNA interactions for Protein: Q2QI47

Ush2A, Usherin, mousemouse

Predictions only

Length 5,193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ush2AQ2QI47 Rian-210ENSMUST00000182689 295 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Gm4275-203ENSMUST00000210214 1298 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 2310039L15Rik-203ENSMUST00000220058 727 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 AC161877.1-201ENSMUST00000227736 699 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Eef1b2-204ENSMUST00000129339 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Mak16-201ENSMUST00000033983 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Stx17-203ENSMUST00000107721 1771 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Lrrc51-204ENSMUST00000106964 872 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Pip5k1bos-201ENSMUST00000126936 684 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Gm16548-201ENSMUST00000133341 1226 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Gm24346-201ENSMUST00000158712 194 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Airn-204ENSMUST00000160932 842 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Il19-204ENSMUST00000187916 720 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Gm38328-201ENSMUST00000195582 317 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Gm42997-201ENSMUST00000196074 918 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Pcdh7-207ENSMUST00000199310 659 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Acsm5-204ENSMUST00000207387 1130 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 1700123O20Rik-203ENSMUST00000227269 893 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Htr1b-201ENSMUST00000051005 1273 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Rarres2-201ENSMUST00000009425 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Clec10a-202ENSMUST00000102571 1496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Fcrla-203ENSMUST00000159171 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Katna1-202ENSMUST00000165806 1775 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Katna1-201ENSMUST00000019929 1774 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Esd-201ENSMUST00000022573 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Gm45088-201ENSMUST00000207066 1408 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Snx29-201ENSMUST00000096273 1622 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Ighv2-5-201ENSMUST00000103449 347 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Gm17233-201ENSMUST00000168470 698 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Mir8114-201ENSMUST00000183582 111 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Slc22a14-204ENSMUST00000170400 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Fhitos-201ENSMUST00000160149 1511 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Nbdy-204ENSMUST00000185492 1346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Hsd3b1-202ENSMUST00000107016 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Gm32540-201ENSMUST00000207174 1872 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Krtap22-2-201ENSMUST00000178913 380 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Trav18-202ENSMUST00000186573 325 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Gm44156-201ENSMUST00000203885 1189 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Gm29803-201ENSMUST00000205069 375 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Gm8796-201ENSMUST00000219122 936 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Gm25129-201ENSMUST00000082651 133 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Myc-204ENSMUST00000160009 1765 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Gm12376-201ENSMUST00000120538 607 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Gm14666-201ENSMUST00000121121 843 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Gm43693-201ENSMUST00000196072 1249 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Gm31363-201ENSMUST00000199362 541 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 AC154264.2-201ENSMUST00000216569 403 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Gm39307-201ENSMUST00000216780 1037 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Olfr518-201ENSMUST00000059617 1002 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Lgals9-201ENSMUST00000073001 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms