Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms