Protein–RNA interactions for Protein: Q14C51

Ptcd3, Pentatricopeptide repeat domain-containing protein 3, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 685 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptcd3Q14C51 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Ptcd3Q14C51 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
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Ptcd3Q14C51 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
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Ptcd3Q14C51 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms