Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 AC132104.1-201ENSMUST00000213615 260 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Nme5-201ENSMUST00000079287 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Olfr619-201ENSMUST00000098196 1124 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Defb30-202ENSMUST00000111207 989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Ms4a5-202ENSMUST00000186937 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 AC154441.1-201ENSMUST00000223653 1006 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 CT025538.2-201ENSMUST00000226083 772 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Acrbp-201ENSMUST00000032481 584 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Tas2r117-201ENSMUST00000068302 1158 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Gm2721-201ENSMUST00000222380 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Npm1-204ENSMUST00000109354 1157 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Gm23673-201ENSMUST00000157474 298 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Esp18-201ENSMUST00000179848 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 4930599A14Rik-201ENSMUST00000186724 387 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Gm28455-201ENSMUST00000189105 1290 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Gm38384-201ENSMUST00000195413 1122 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Gm5149-202ENSMUST00000199980 1250 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Gm44840-201ENSMUST00000208983 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Gm30671-201ENSMUST00000214898 318 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.4 ms