Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 Gm3755-201ENSMUST00000169555 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 Lexm-202ENSMUST00000106788 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 Gm25562-201ENSMUST00000104608 133 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 Gm14497-201ENSMUST00000119537 580 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 Gm12453-201ENSMUST00000121981 331 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 Gm42433-201ENSMUST00000196806 940 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 9530034A14Rik-201ENSMUST00000197919 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 Tspo2-201ENSMUST00000024794 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 Mok-203ENSMUST00000084974 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 Gm5308-201ENSMUST00000196752 1354 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 Gm14820-201ENSMUST00000126286 1449 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 Slc38a5-203ENSMUST00000115591 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 Ccdc90b-202ENSMUST00000085017 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 Art5-203ENSMUST00000106935 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 Klk6-201ENSMUST00000107966 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 Gm9133-201ENSMUST00000118289 540 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 Gm13019-201ENSMUST00000120000 276 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 Mir1905-201ENSMUST00000122779 82 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 Gm11884-201ENSMUST00000131639 641 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 Gm13572-201ENSMUST00000153675 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 Bloc1s1-205ENSMUST00000153731 613 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 Gm17214-201ENSMUST00000164501 541 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 Malat1-205ENSMUST00000174808 656 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 1700017I07Rik-201ENSMUST00000184823 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 Gm42430-201ENSMUST00000197209 616 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 Gm43778-201ENSMUST00000199438 199 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 Cldnd2-202ENSMUST00000206839 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 Gm45613-201ENSMUST00000210718 443 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 E230034D01Rik-201ENSMUST00000214440 1212 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 AI463170-202ENSMUST00000218453 558 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 Gm43152-201ENSMUST00000202495 1638 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 1700125H20Rik-202ENSMUST00000100681 687 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 Banf2-202ENSMUST00000110032 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 Fam3a-204ENSMUST00000114141 1243 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 Gm12389-201ENSMUST00000117696 418 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 Gm15197-201ENSMUST00000120526 478 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 Gm20471-201ENSMUST00000172793 626 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 Gm24328-201ENSMUST00000175104 67 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 Gm28529-201ENSMUST00000186159 387 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 4930543N07Rik-202ENSMUST00000209503 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 Banf2-201ENSMUST00000037722 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 Olfr538-201ENSMUST00000084457 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63 ms