Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Arhgap19-204ENSMUST00000177495 1652 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Gm13134-201ENSMUST00000132106 738 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Rpl17-ps11-201ENSMUST00000161946 729 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Gm29642-201ENSMUST00000186170 921 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Gm6352-201ENSMUST00000203583 1134 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Gm44173-201ENSMUST00000204316 132 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Gm44939-201ENSMUST00000206939 814 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Fcer2a-205ENSMUST00000208145 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Gm39147-202ENSMUST00000211730 882 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Gm18504-201ENSMUST00000220917 929 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 CT030035.1-201ENSMUST00000223964 935 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Ccdc136-207ENSMUST00000154619 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Slc4a8-204ENSMUST00000162049 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Plekhg5-202ENSMUST00000105661 3842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 1700019D03Rik-205ENSMUST00000190726 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Gm35611-201ENSMUST00000205323 799 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Nudc-ps1-201ENSMUST00000209275 551 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 CU025215.1-201ENSMUST00000222986 603 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Apba2-201ENSMUST00000032732 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Gm13456-201ENSMUST00000118928 1365 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 4933405D12Rik-201ENSMUST00000180557 1383 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Tekt2-202ENSMUST00000102616 1542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 AC113282.5-201ENSMUST00000224330 1679 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Olfr582-203ENSMUST00000211036 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Naa38-204ENSMUST00000144531 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Fxyd7-202ENSMUST00000206341 620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Fxyd7-201ENSMUST00000073892 693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Gm10134-201ENSMUST00000074761 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Tuft1-204ENSMUST00000196733 2555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Prdm9-205ENSMUST00000147532 1447 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 3110001I22Rik-201ENSMUST00000035426 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Gm5159-201ENSMUST00000212733 1652 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Gm15929-201ENSMUST00000138926 1161 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Gm16013-201ENSMUST00000152249 353 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Gm22662-201ENSMUST00000175290 256 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Gm44236-201ENSMUST00000204492 513 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Picalm-201ENSMUST00000049537 3528 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Dmtf1-201ENSMUST00000071921 3806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Pde1b-205ENSMUST00000227955 3258 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Lims1-201ENSMUST00000020077 1565 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Gm6268-201ENSMUST00000115253 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Ifna6-201ENSMUST00000105146 570 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Xbp1-204ENSMUST00000149623 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Ifna11-201ENSMUST00000170428 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Krtap3-2-201ENSMUST00000092699 1031 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Ifna1-201ENSMUST00000094972 570 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Ccdc136-201ENSMUST00000096084 3826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Pigc-205ENSMUST00000193784 4207 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.7 ms