Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Cenpn-203ENSMUST00000212263 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc21bQ0HA38 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc21bQ0HA38 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc21bQ0HA38 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc21bQ0HA38 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc21bQ0HA38 Usp2-208ENSMUST00000177054 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc21bQ0HA38 Dcaf12-201ENSMUST00000030145 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc21bQ0HA38 4921524J17Rik-201ENSMUST00000047749 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc21bQ0HA38 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc21bQ0HA38 Nr1i3-201ENSMUST00000005820 1414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc21bQ0HA38 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc21bQ0HA38 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc21bQ0HA38 Adam20-201ENSMUST00000056331 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc21bQ0HA38 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc21bQ0HA38 Igkv3-10-201ENSMUST00000103397 356 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc21bQ0HA38 Mir432-201ENSMUST00000157230 75 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc21bQ0HA38 Mrgpra2a-201ENSMUST00000159004 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc21bQ0HA38 Gm16547-201ENSMUST00000159474 293 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc21bQ0HA38 Krtcap2-204ENSMUST00000168900 582 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc21bQ0HA38 Gm3233-201ENSMUST00000168997 693 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc21bQ0HA38 Cdhr4-208ENSMUST00000176373 492 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc21bQ0HA38 Gm18014-201ENSMUST00000183369 817 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc21bQ0HA38 2610016A17Rik-201ENSMUST00000185211 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc21bQ0HA38 Gm43854-201ENSMUST00000200418 394 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc21bQ0HA38 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc21bQ0HA38 4930447C11Rik-201ENSMUST00000204503 928 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc21bQ0HA38 CT030652.1-201ENSMUST00000227377 1235 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc21bQ0HA38 Hsd3b3-204ENSMUST00000107019 1533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc21bQ0HA38 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc21bQ0HA38 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc21bQ0HA38 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc21bQ0HA38 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc21bQ0HA38 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc21bQ0HA38 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc21bQ0HA38 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc21bQ0HA38 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc21bQ0HA38 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc21bQ0HA38 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc21bQ0HA38 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc21bQ0HA38 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc21bQ0HA38 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc21bQ0HA38 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc21bQ0HA38 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc21bQ0HA38 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc21bQ0HA38 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc21bQ0HA38 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc21bQ0HA38 Gm13871-202ENSMUST00000107319 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc21bQ0HA38 Gm11757-202ENSMUST00000107321 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc21bQ0HA38 Bcat2-208ENSMUST00000211173 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc21bQ0HA38 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc21bQ0HA38 Colec11-201ENSMUST00000036136 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc21bQ0HA38 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc21bQ0HA38 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc21bQ0HA38 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc21bQ0HA38 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc21bQ0HA38 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc21bQ0HA38 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc21bQ0HA38 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc21bQ0HA38 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc21bQ0HA38 Snrnp25-202ENSMUST00000121182 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Ttc21bQ0HA38 Tmprss11c-202ENSMUST00000196462 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Ttc21bQ0HA38 Acyp1-201ENSMUST00000008966 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc21bQ0HA38 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Ttc21bQ0HA38 Sec13-201ENSMUST00000032440 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc21bQ0HA38 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc21bQ0HA38 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc21bQ0HA38 Eef1akmt4-202ENSMUST00000119224 1464 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc21bQ0HA38 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc21bQ0HA38 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc21bQ0HA38 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc21bQ0HA38 Snx27-208ENSMUST00000200642 1308 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ttc21bQ0HA38 Gps2-202ENSMUST00000072581 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ttc21bQ0HA38 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ttc21bQ0HA38 Tubb1-201ENSMUST00000016399 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ttc21bQ0HA38 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ttc21bQ0HA38 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ttc21bQ0HA38 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ttc21bQ0HA38 AC113282.1-201ENSMUST00000225278 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ttc21bQ0HA38 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ttc21bQ0HA38 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ttc21bQ0HA38 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ttc21bQ0HA38 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ttc21bQ0HA38 Gm12986-201ENSMUST00000119037 967 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ttc21bQ0HA38 Gm14113-201ENSMUST00000121399 976 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ttc21bQ0HA38 Gm9625-201ENSMUST00000180422 955 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ttc21bQ0HA38 Gm6606-201ENSMUST00000193613 947 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ttc21bQ0HA38 Gm42751-201ENSMUST00000198065 559 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ttc21bQ0HA38 Cdk5-203ENSMUST00000198990 783 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ttc21bQ0HA38 Gm18010-201ENSMUST00000203553 202 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ttc21bQ0HA38 Gm31520-203ENSMUST00000204874 647 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ttc21bQ0HA38 1700086D15Rik-201ENSMUST00000020855 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ttc21bQ0HA38 Gm9204-201ENSMUST00000212641 947 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms