Protein–RNA interactions for Protein: Q09098

Pate4, Prostate and testis expressed protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate4Q09098 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Zmat1-201ENSMUST00000064659 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 125 ms