Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Arhgap19-204ENSMUST00000177495 1652 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Trav13d-1-201ENSMUST00000103588 396 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Gm11422-201ENSMUST00000118925 1103 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Gm15197-201ENSMUST00000120526 478 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Gm43001-201ENSMUST00000198925 603 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Gm7596-202ENSMUST00000202171 737 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 4933402C05Rik-201ENSMUST00000208189 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Stt3a-209ENSMUST00000217599 285 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 AC154305.2-201ENSMUST00000225813 901 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Pgap2-201ENSMUST00000033292 1201 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Gm5805-201ENSMUST00000072779 456 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Gm6024-201ENSMUST00000117850 1558 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 1500004A13Rik-209ENSMUST00000185189 1659 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Gm14497-201ENSMUST00000119537 580 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Gm12705-201ENSMUST00000129460 872 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Gm13530-201ENSMUST00000134014 390 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Gm45716-203ENSMUST00000153734 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Gm4982-201ENSMUST00000160440 1098 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Gm8723-201ENSMUST00000166076 820 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Gm8701-201ENSMUST00000169259 874 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Taar8c-201ENSMUST00000170267 1035 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Gm19587-201ENSMUST00000191395 545 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Gm7082-201ENSMUST00000209880 969 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 AC122024.3-201ENSMUST00000217719 294 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Myoz2-201ENSMUST00000029761 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Taar8a-201ENSMUST00000051133 1035 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Tdpoz3-201ENSMUST00000081780 1098 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms