Protein–RNA interactions for Protein: Q05895

Thbs3, Thrombospondin-3, mousemouse

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs3Q05895 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Thbs3Q05895 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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