Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Gm37741-201ENSMUST00000191768 1256 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Gm18690-201ENSMUST00000204488 985 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Gm34664-202ENSMUST00000207661 1032 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Olfr490-201ENSMUST00000210114 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Olfr805-201ENSMUST00000078876 960 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Gm5715-201ENSMUST00000196854 1465 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 9630028H03Rik-202ENSMUST00000153402 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 4933400A11Rik-203ENSMUST00000112102 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Gm4342-201ENSMUST00000118982 367 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Klrd1-203ENSMUST00000119520 919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Gm11389-201ENSMUST00000121407 430 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Vmn1r-ps18-201ENSMUST00000176901 876 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Gm28425-202ENSMUST00000191542 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Gm2814-201ENSMUST00000207074 1277 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Gm33242-201ENSMUST00000212130 1057 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Olfr991-ps1-201ENSMUST00000215967 908 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 AC167977.2-201ENSMUST00000225676 682 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 AC080021.1-201ENSMUST00000228104 700 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Prh1-201ENSMUST00000074042 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 1810053B23Rik-205ENSMUST00000188056 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Gm17026-201ENSMUST00000166674 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Gm17124-201ENSMUST00000168320 1379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Gm13731-201ENSMUST00000117332 196 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Gm29617-203ENSMUST00000186558 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Gm5309-201ENSMUST00000197416 677 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Gm19095-201ENSMUST00000220533 730 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms