Protein–RNA interactions for Protein: Q03958

Pfdn6, Prefoldin subunit 6, mousemouse

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Length 127 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn6Q03958 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pfdn6Q03958 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pfdn6Q03958 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pfdn6Q03958 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pfdn6Q03958 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pfdn6Q03958 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pfdn6Q03958 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pfdn6Q03958 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Pfdn6Q03958 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Pfdn6Q03958 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pfdn6Q03958 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pfdn6Q03958 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pfdn6Q03958 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Pfdn6Q03958 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Pfdn6Q03958 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pfdn6Q03958 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pfdn6Q03958 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pfdn6Q03958 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pfdn6Q03958 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Pfdn6Q03958 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pfdn6Q03958 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Pfdn6Q03958 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pfdn6Q03958 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pfdn6Q03958 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Pfdn6Q03958 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pfdn6Q03958 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pfdn6Q03958 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pfdn6Q03958 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pfdn6Q03958 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pfdn6Q03958 Lamb1-201ENSMUST00000002979 5784 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pfdn6Q03958 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pfdn6Q03958 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Pfdn6Q03958 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pfdn6Q03958 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pfdn6Q03958 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pfdn6Q03958 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pfdn6Q03958 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pfdn6Q03958 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pfdn6Q03958 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pfdn6Q03958 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pfdn6Q03958 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pfdn6Q03958 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pfdn6Q03958 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pfdn6Q03958 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pfdn6Q03958 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pfdn6Q03958 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pfdn6Q03958 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pfdn6Q03958 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pfdn6Q03958 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pfdn6Q03958 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pfdn6Q03958 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pfdn6Q03958 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Pfdn6Q03958 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pfdn6Q03958 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Pfdn6Q03958 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pfdn6Q03958 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pfdn6Q03958 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Pfdn6Q03958 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pfdn6Q03958 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pfdn6Q03958 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pfdn6Q03958 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pfdn6Q03958 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pfdn6Q03958 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pfdn6Q03958 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pfdn6Q03958 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pfdn6Q03958 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pfdn6Q03958 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pfdn6Q03958 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pfdn6Q03958 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pfdn6Q03958 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pfdn6Q03958 Il1rap-202ENSMUST00000096129 4438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pfdn6Q03958 Sdk1-201ENSMUST00000074546 7063 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pfdn6Q03958 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pfdn6Q03958 Zcchc4-201ENSMUST00000031077 5743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pfdn6Q03958 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pfdn6Q03958 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Pfdn6Q03958 Zmynd8-205ENSMUST00000109266 5072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Pfdn6Q03958 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Pfdn6Q03958 Abca3-203ENSMUST00000117337 5202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pfdn6Q03958 Xirp1-201ENSMUST00000111635 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pfdn6Q03958 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pfdn6Q03958 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pfdn6Q03958 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pfdn6Q03958 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pfdn6Q03958 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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