Protein–RNA interactions for Protein: Q01231

Gja5, Gap junction alpha-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja5Q01231 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gja5Q01231 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gja5Q01231 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gja5Q01231 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gja5Q01231 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gja5Q01231 Dcaf12-201ENSMUST00000030145 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gja5Q01231 Ighv8-11-201ENSMUST00000103536 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gja5Q01231 Ighv1-74-201ENSMUST00000103543 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gja5Q01231 1700025C18Rik-201ENSMUST00000109304 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gja5Q01231 Mir1249-201ENSMUST00000116791 98 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gja5Q01231 Olfr29-ps1-201ENSMUST00000117959 963 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gja5Q01231 Slc1a3-208ENSMUST00000157065 728 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gja5Q01231 Gm17115-201ENSMUST00000164075 885 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gja5Q01231 Prr3-206ENSMUST00000173585 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gja5Q01231 Ighv1-70-201ENSMUST00000196509 351 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gja5Q01231 Calca-207ENSMUST00000206853 720 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gja5Q01231 Gm18001-201ENSMUST00000212023 688 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gja5Q01231 AC164087.2-201ENSMUST00000216206 1072 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gja5Q01231 AC154435.1-201ENSMUST00000223938 959 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gja5Q01231 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gja5Q01231 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gja5Q01231 Olfr669-201ENSMUST00000098164 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gja5Q01231 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gja5Q01231 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gja5Q01231 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gja5Q01231 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gja5Q01231 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gja5Q01231 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gja5Q01231 Gm44740-201ENSMUST00000205603 1614 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Gja5Q01231 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gja5Q01231 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Gja5Q01231 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gja5Q01231 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gja5Q01231 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gja5Q01231 Ppm1b-203ENSMUST00000112305 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gja5Q01231 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gja5Q01231 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gja5Q01231 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gja5Q01231 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gja5Q01231 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gja5Q01231 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gja5Q01231 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gja5Q01231 Gm11380-201ENSMUST00000118067 560 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gja5Q01231 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gja5Q01231 Gm8659-201ENSMUST00000120024 1084 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gja5Q01231 Gm13954-201ENSMUST00000123441 543 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gja5Q01231 AU015836-205ENSMUST00000163458 911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gja5Q01231 Snord55-201ENSMUST00000174939 79 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gja5Q01231 Tmem242-202ENSMUST00000185896 780 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gja5Q01231 Gm29521-201ENSMUST00000187061 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gja5Q01231 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gja5Q01231 Gm43460-201ENSMUST00000202491 1057 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gja5Q01231 Rhno1-207ENSMUST00000223237 1081 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gja5Q01231 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gja5Q01231 AC154436.1-201ENSMUST00000227272 782 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gja5Q01231 4933407L21Rik-201ENSMUST00000027426 1146 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gja5Q01231 Olfr1015-201ENSMUST00000047870 1016 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gja5Q01231 Gm7589-201ENSMUST00000085631 534 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gja5Q01231 Dedd-202ENSMUST00000097467 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gja5Q01231 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gja5Q01231 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gja5Q01231 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gja5Q01231 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gja5Q01231 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gja5Q01231 Zfp869-201ENSMUST00000080987 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gja5Q01231 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gja5Q01231 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gja5Q01231 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gja5Q01231 AC107763.1-201ENSMUST00000226082 1365 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gja5Q01231 H2-M10.1-201ENSMUST00000025322 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gja5Q01231 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gja5Q01231 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gja5Q01231 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gja5Q01231 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gja5Q01231 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gja5Q01231 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gja5Q01231 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gja5Q01231 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gja5Q01231 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gja5Q01231 Gm43152-201ENSMUST00000202495 1638 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gja5Q01231 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gja5Q01231 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gja5Q01231 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gja5Q01231 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gja5Q01231 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gja5Q01231 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gja5Q01231 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gja5Q01231 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gja5Q01231 Mrps36-203ENSMUST00000109333 701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gja5Q01231 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gja5Q01231 Atp5g3-202ENSMUST00000111996 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gja5Q01231 Nup188-202ENSMUST00000113634 534 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gja5Q01231 Gm13700-201ENSMUST00000118624 1128 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gja5Q01231 Tnnt1-206ENSMUST00000163710 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gja5Q01231 Mir8091-201ENSMUST00000183602 139 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gja5Q01231 Mir6359-201ENSMUST00000183668 81 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gja5Q01231 Gm29304-201ENSMUST00000186555 695 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gja5Q01231 Gm29223-201ENSMUST00000188867 695 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gja5Q01231 Gm37921-201ENSMUST00000194333 695 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gja5Q01231 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms