Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Gm28505-201ENSMUST00000190466 680 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Grin2bQ01097 Gm29808-201ENSMUST00000194419 468 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Grin2bQ01097 5033404E19Rik-202ENSMUST00000194748 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Grin2bQ01097 Gm43811-201ENSMUST00000202862 695 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Grin2bQ01097 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Grin2bQ01097 Fcer1g-201ENSMUST00000079957 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Grin2bQ01097 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Grin2bQ01097 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Grin2bQ01097 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Grin2bQ01097 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Grin2bQ01097 Atp5s-204ENSMUST00000220916 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Grin2bQ01097 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Grin2bQ01097 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Grin2bQ01097 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Grin2bQ01097 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Grin2bQ01097 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Grin2bQ01097 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Grin2bQ01097 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Grin2bQ01097 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Grin2bQ01097 Psmb3-201ENSMUST00000103147 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Grin2bQ01097 Tcstv1-201ENSMUST00000178510 1280 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Grin2bQ01097 Gm21958-201ENSMUST00000178832 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Grin2bQ01097 Gm5976-201ENSMUST00000180794 996 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Grin2bQ01097 1700084F23Rik-202ENSMUST00000188461 747 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Grin2bQ01097 AC155709.2-201ENSMUST00000219360 678 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Grin2bQ01097 AC140314.1-201ENSMUST00000219549 554 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Grin2bQ01097 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Grin2bQ01097 AC107711.4-201ENSMUST00000228948 440 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Grin2bQ01097 Mrgpra1-201ENSMUST00000098438 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Grin2bQ01097 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Grin2bQ01097 B4galnt2-201ENSMUST00000038343 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Grin2bQ01097 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Grin2bQ01097 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Grin2bQ01097 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Grin2bQ01097 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Grin2bQ01097 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Grin2bQ01097 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Grin2bQ01097 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Grin2bQ01097 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Grin2bQ01097 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Grin2bQ01097 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Grin2bQ01097 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Grin2bQ01097 Thoc6-202ENSMUST00000095579 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Grin2bQ01097 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Grin2bQ01097 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Grin2bQ01097 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Grin2bQ01097 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Grin2bQ01097 Zscan21-201ENSMUST00000062350 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Grin2bQ01097 Gm12009-201ENSMUST00000121361 1100 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Grin2bQ01097 Dnajc4-202ENSMUST00000179118 840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Grin2bQ01097 Gm27444-201ENSMUST00000184157 137 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Grin2bQ01097 Gm28356-201ENSMUST00000186941 927 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Grin2bQ01097 1700088E04Rik-207ENSMUST00000188562 631 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Grin2bQ01097 Gm40414-201ENSMUST00000197608 481 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Grin2bQ01097 Gm40639-201ENSMUST00000214642 625 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Grin2bQ01097 Gm5040-201ENSMUST00000218609 800 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Grin2bQ01097 Olfr1335-202ENSMUST00000219094 1148 ntAPPRIS P2 BASIC18■□□□□ 0.47
Grin2bQ01097 AC116797.2-202ENSMUST00000223587 1017 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Grin2bQ01097 CT030035.1-201ENSMUST00000223964 935 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Grin2bQ01097 Prss1-201ENSMUST00000031910 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Grin2bQ01097 Olfr1335-201ENSMUST00000084313 1148 ntAPPRIS ALT2 BASIC18■□□□□ 0.47
Grin2bQ01097 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Grin2bQ01097 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Grin2bQ01097 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Grin2bQ01097 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Grin2bQ01097 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Grin2bQ01097 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Grin2bQ01097 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Grin2bQ01097 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Grin2bQ01097 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Grin2bQ01097 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Grin2bQ01097 Gm11736-201ENSMUST00000121468 505 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Grin2bQ01097 Arl14-201ENSMUST00000183126 1200 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Grin2bQ01097 AC124613.1-201ENSMUST00000198711 88 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Grin2bQ01097 Gm43726-201ENSMUST00000199110 775 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Grin2bQ01097 Ccdc114-205ENSMUST00000211367 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Grin2bQ01097 AC129217.1-201ENSMUST00000225181 642 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Grin2bQ01097 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Grin2bQ01097 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Grin2bQ01097 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Grin2bQ01097 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Grin2bQ01097 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Grin2bQ01097 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Grin2bQ01097 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Grin2bQ01097 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Grin2bQ01097 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Grin2bQ01097 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Grin2bQ01097 Olfr434-203ENSMUST00000216562 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Grin2bQ01097 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Grin2bQ01097 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Grin2bQ01097 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Grin2bQ01097 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Grin2bQ01097 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Grin2bQ01097 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Grin2bQ01097 Dmrtc1b-201ENSMUST00000101324 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Grin2bQ01097 Lime1-202ENSMUST00000108804 960 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Grin2bQ01097 Dmrtc1b-202ENSMUST00000113609 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Grin2bQ01097 Gm4943-201ENSMUST00000132879 424 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Grin2bQ01097 Smim6-201ENSMUST00000132961 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Grin2bQ01097 Olfr527-201ENSMUST00000172230 978 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms