Protein–RNA interactions for Protein: P97474

Pitx2, Pituitary homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx2P97474 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pitx2P97474 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pitx2P97474 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pitx2P97474 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Pitx2P97474 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pitx2P97474 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pitx2P97474 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Pitx2P97474 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pitx2P97474 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pitx2P97474 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pitx2P97474 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pitx2P97474 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pitx2P97474 Kcne2-201ENSMUST00000047383 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pitx2P97474 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pitx2P97474 Nxpe5-203ENSMUST00000159964 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pitx2P97474 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pitx2P97474 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pitx2P97474 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pitx2P97474 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pitx2P97474 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pitx2P97474 H2-T3-201ENSMUST00000025312 2114 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pitx2P97474 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pitx2P97474 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pitx2P97474 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pitx2P97474 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pitx2P97474 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Pitx2P97474 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pitx2P97474 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pitx2P97474 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pitx2P97474 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pitx2P97474 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pitx2P97474 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pitx2P97474 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pitx2P97474 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pitx2P97474 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Pitx2P97474 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pitx2P97474 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pitx2P97474 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pitx2P97474 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pitx2P97474 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pitx2P97474 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pitx2P97474 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pitx2P97474 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Pitx2P97474 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Pitx2P97474 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pitx2P97474 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pitx2P97474 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pitx2P97474 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Pitx2P97474 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Pitx2P97474 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pitx2P97474 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Pitx2P97474 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pitx2P97474 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Pitx2P97474 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Pitx2P97474 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pitx2P97474 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Pitx2P97474 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pitx2P97474 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pitx2P97474 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Pitx2P97474 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pitx2P97474 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pitx2P97474 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pitx2P97474 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pitx2P97474 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pitx2P97474 Colq-201ENSMUST00000112027 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pitx2P97474 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pitx2P97474 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pitx2P97474 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pitx2P97474 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pitx2P97474 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Pitx2P97474 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pitx2P97474 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pitx2P97474 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pitx2P97474 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pitx2P97474 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pitx2P97474 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pitx2P97474 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Pitx2P97474 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pitx2P97474 Plpp3-201ENSMUST00000064139 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pitx2P97474 Gm13652-201ENSMUST00000143898 3412 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pitx2P97474 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Pitx2P97474 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pitx2P97474 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pitx2P97474 Mefv-202ENSMUST00000100222 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pitx2P97474 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pitx2P97474 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pitx2P97474 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pitx2P97474 1500012K07Rik-201ENSMUST00000181846 2345 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pitx2P97474 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pitx2P97474 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pitx2P97474 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pitx2P97474 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pitx2P97474 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pitx2P97474 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pitx2P97474 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pitx2P97474 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pitx2P97474 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pitx2P97474 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pitx2P97474 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pitx2P97474 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms