Protein–RNA interactions for Protein: P97355

Sms, Spermine synthase, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmsP97355 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SmsP97355 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SmsP97355 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SmsP97355 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SmsP97355 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SmsP97355 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SmsP97355 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SmsP97355 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SmsP97355 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SmsP97355 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SmsP97355 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SmsP97355 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
SmsP97355 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SmsP97355 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SmsP97355 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SmsP97355 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SmsP97355 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SmsP97355 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SmsP97355 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SmsP97355 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
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SmsP97355 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SmsP97355 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SmsP97355 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SmsP97355 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SmsP97355 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SmsP97355 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SmsP97355 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SmsP97355 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SmsP97355 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SmsP97355 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
SmsP97355 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SmsP97355 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SmsP97355 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SmsP97355 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SmsP97355 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SmsP97355 2310074N15Rik-201ENSMUST00000198276 582 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
SmsP97355 Fabp6-201ENSMUST00000020672 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SmsP97355 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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SmsP97355 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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SmsP97355 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SmsP97355 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SmsP97355 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SmsP97355 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SmsP97355 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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SmsP97355 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SmsP97355 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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SmsP97355 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
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SmsP97355 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SmsP97355 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SmsP97355 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SmsP97355 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SmsP97355 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SmsP97355 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms