Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
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