Protein–RNA interactions for Protein: P84244

H3f3a, Histone H3.3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3aP84244 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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