Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Irx2P81066 Olfr169-203ENSMUST00000215476 2476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Irx2P81066 P4ha1-201ENSMUST00000009789 4043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Irx2P81066 2900060N12Rik-201ENSMUST00000221412 3721 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Irx2P81066 Pax6-206ENSMUST00000111086 2601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Irx2P81066 Mov10-207ENSMUST00000168015 3460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Irx2P81066 Mov10-201ENSMUST00000002297 3498 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Irx2P81066 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Irx2P81066 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Irx2P81066 Carmil1-202ENSMUST00000110398 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Irx2P81066 Tmprss13-201ENSMUST00000034597 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Irx2P81066 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Irx2P81066 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Irx2P81066 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Irx2P81066 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Irx2P81066 Gm18539-201ENSMUST00000204745 1090 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Irx2P81066 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Irx2P81066 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Irx2P81066 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Irx2P81066 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Irx2P81066 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Irx2P81066 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Irx2P81066 Ralgapb-202ENSMUST00000109485 6709 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Irx2P81066 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Irx2P81066 Rab3gap2-201ENSMUST00000069652 7052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Irx2P81066 Zfp185-201ENSMUST00000114546 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Irx2P81066 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Irx2P81066 Tom1l2-203ENSMUST00000093048 4864 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Irx2P81066 Sfi1-210ENSMUST00000140846 3604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Irx2P81066 9230112E08Rik-202ENSMUST00000189441 3352 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Irx2P81066 Capn3-202ENSMUST00000028749 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Irx2P81066 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Irx2P81066 AC108416.1-201ENSMUST00000228755 1558 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Irx2P81066 Brcc3-201ENSMUST00000033544 4310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Irx2P81066 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Irx2P81066 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Irx2P81066 Atp13a4-201ENSMUST00000039090 2878 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Irx2P81066 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Irx2P81066 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Irx2P81066 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Irx2P81066 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Irx2P81066 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Irx2P81066 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Irx2P81066 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Irx2P81066 Gm8705-201ENSMUST00000180823 812 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Irx2P81066 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Irx2P81066 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Irx2P81066 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Irx2P81066 Tsga8-201ENSMUST00000049420 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Irx2P81066 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Irx2P81066 Wdr24-201ENSMUST00000026833 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Irx2P81066 Oprm1-213ENSMUST00000105604 1616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Irx2P81066 Gcc1-201ENSMUST00000064377 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Irx2P81066 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Irx2P81066 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Irx2P81066 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Irx2P81066 Zscan21-202ENSMUST00000080732 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Irx2P81066 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Irx2P81066 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Irx2P81066 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Irx2P81066 4930478P22Rik-203ENSMUST00000202026 2060 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Irx2P81066 Kdm4a-201ENSMUST00000050288 3279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Irx2P81066 Tmprss7-201ENSMUST00000114562 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Irx2P81066 Lrtm1-203ENSMUST00000224760 3060 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Irx2P81066 Rassf5-202ENSMUST00000068564 3076 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Irx2P81066 Pde2a-201ENSMUST00000163751 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Irx2P81066 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Irx2P81066 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Irx2P81066 Gm32219-201ENSMUST00000221234 1819 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Irx2P81066 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Irx2P81066 Palm2-201ENSMUST00000102904 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Irx2P81066 Irf9-203ENSMUST00000134863 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Irx2P81066 Slc27a6-201ENSMUST00000025500 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Irx2P81066 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Irx2P81066 Atxn1l-201ENSMUST00000093162 7526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Irx2P81066 Fhod1-201ENSMUST00000014922 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Irx2P81066 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Irx2P81066 Zfp60-208ENSMUST00000167955 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Irx2P81066 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Irx2P81066 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Irx2P81066 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Irx2P81066 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Irx2P81066 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Irx2P81066 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Irx2P81066 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Irx2P81066 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Irx2P81066 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Irx2P81066 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Irx2P81066 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Irx2P81066 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Irx2P81066 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Irx2P81066 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Irx2P81066 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Irx2P81066 Reep1-203ENSMUST00000212792 3339 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Irx2P81066 C2cd5-201ENSMUST00000087485 4265 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Irx2P81066 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Irx2P81066 Galnt16-201ENSMUST00000021558 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Irx2P81066 Gm7932-202ENSMUST00000205047 2194 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Irx2P81066 Wnt5a-202ENSMUST00000112272 3650 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Irx2P81066 Osbpl5-201ENSMUST00000020411 3994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms