Protein–RNA interactions for Protein: P80205

Otx1, Homeobox protein OTX1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx1P80205 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Otx1P80205 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Otx1P80205 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Otx1P80205 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Otx1P80205 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Otx1P80205 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Otx1P80205 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Otx1P80205 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Otx1P80205 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Otx1P80205 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Otx1P80205 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Otx1P80205 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Otx1P80205 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Otx1P80205 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Otx1P80205 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Otx1P80205 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Otx1P80205 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Otx1P80205 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Otx1P80205 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Otx1P80205 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Otx1P80205 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Otx1P80205 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Otx1P80205 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Otx1P80205 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Otx1P80205 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Otx1P80205 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Otx1P80205 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Otx1P80205 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Otx1P80205 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Otx1P80205 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Otx1P80205 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Otx1P80205 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Otx1P80205 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Otx1P80205 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Otx1P80205 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Otx1P80205 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Otx1P80205 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Otx1P80205 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Otx1P80205 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Otx1P80205 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Otx1P80205 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Otx1P80205 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Otx1P80205 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Otx1P80205 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Otx1P80205 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Otx1P80205 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Otx1P80205 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Otx1P80205 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Otx1P80205 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Otx1P80205 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Otx1P80205 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Otx1P80205 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Otx1P80205 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Otx1P80205 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Otx1P80205 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Otx1P80205 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Otx1P80205 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Otx1P80205 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Otx1P80205 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Otx1P80205 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Otx1P80205 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Otx1P80205 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Otx1P80205 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Otx1P80205 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Otx1P80205 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Otx1P80205 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Otx1P80205 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Otx1P80205 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Otx1P80205 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Otx1P80205 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Otx1P80205 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Otx1P80205 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Otx1P80205 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Otx1P80205 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms