Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Usp9xP70398 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Usp9xP70398 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Usp9xP70398 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Usp9xP70398 Gm8873-201ENSMUST00000217847 1439 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Usp9xP70398 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Usp9xP70398 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Usp9xP70398 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Usp9xP70398 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Usp9xP70398 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Usp9xP70398 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Usp9xP70398 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Usp9xP70398 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Usp9xP70398 Gstm4-203ENSMUST00000178808 1462 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Usp9xP70398 Tnnt3-213ENSMUST00000105952 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Usp9xP70398 Tnnt3-215ENSMUST00000105954 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Usp9xP70398 Tnnt3-216ENSMUST00000105955 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Usp9xP70398 Tnnt3-218ENSMUST00000105958 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Usp9xP70398 Styxl1-203ENSMUST00000111162 726 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Usp9xP70398 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Usp9xP70398 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Usp9xP70398 4930507D10Rik-201ENSMUST00000137411 1152 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Usp9xP70398 A230006K03Rik-202ENSMUST00000154958 901 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Usp9xP70398 Tex33-202ENSMUST00000165170 1072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Usp9xP70398 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Usp9xP70398 Tnnt3-225ENSMUST00000179658 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Usp9xP70398 Gm38233-201ENSMUST00000194259 807 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Usp9xP70398 Ckb-ps2-201ENSMUST00000198886 1001 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Usp9xP70398 Gm6518-201ENSMUST00000208450 342 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Usp9xP70398 AC153891.1-201ENSMUST00000213761 742 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Usp9xP70398 Nsmce2-203ENSMUST00000227173 1122 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Usp9xP70398 Tex33-201ENSMUST00000074380 1147 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Usp9xP70398 Tnnt3-202ENSMUST00000078497 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Usp9xP70398 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Usp9xP70398 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Usp9xP70398 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Usp9xP70398 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Usp9xP70398 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Usp9xP70398 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Usp9xP70398 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Usp9xP70398 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Usp9xP70398 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC9.52□□□□□ -0.88
Usp9xP70398 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Usp9xP70398 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Usp9xP70398 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Usp9xP70398 A230009B12Rik-202ENSMUST00000159602 1810 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Usp9xP70398 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Usp9xP70398 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Usp9xP70398 Gm26818-201ENSMUST00000181367 1360 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
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Usp9xP70398 4930533B01Rik-201ENSMUST00000123377 1029 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
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Usp9xP70398 Gm12972-201ENSMUST00000152986 1006 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
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Usp9xP70398 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 BC028471-201ENSMUST00000200937 520 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
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Usp9xP70398 4933402C05Rik-201ENSMUST00000208189 1035 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Gm18256-201ENSMUST00000209087 907 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
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Usp9xP70398 Cryab-205ENSMUST00000216755 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
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Usp9xP70398 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Slc1a4-202ENSMUST00000109594 3926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Gm5308-201ENSMUST00000196752 1354 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Gm5808-201ENSMUST00000178090 357 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Gm7929-201ENSMUST00000178711 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Gm4858-201ENSMUST00000179064 735 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Gm3015-202ENSMUST00000179803 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Mt1-203ENSMUST00000212291 633 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Il18-203ENSMUST00000213916 885 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 AC158986.2-201ENSMUST00000227487 618 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Rnasek-201ENSMUST00000040428 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Micu1-212ENSMUST00000179709 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Mettl18-202ENSMUST00000111490 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Hipk2-204ENSMUST00000160360 3907 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms