Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Rps29P62274 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Rps29P62274 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Rps29P62274 C4b-201ENSMUST00000069507 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Rps29P62274 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Gm9639-201ENSMUST00000172205 678 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Malat1-205ENSMUST00000174808 656 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Gm5294-201ENSMUST00000179205 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Rps29P62274 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Rps29P62274 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Rps29P62274 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Rps29P62274 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Rps29P62274 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Rps29P62274 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms