Protein–RNA interactions for Protein: P59240

Nphp4, Nephrocystin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp4P59240 Gm5641-201ENSMUST00000091130 1488 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nphp4P59240 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nphp4P59240 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nphp4P59240 Gm23612-201ENSMUST00000103823 110 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nphp4P59240 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nphp4P59240 Gm13026-201ENSMUST00000140113 608 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nphp4P59240 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nphp4P59240 Gm23576-201ENSMUST00000179918 110 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nphp4P59240 Gm31274-201ENSMUST00000197356 229 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nphp4P59240 AC165249.1-202ENSMUST00000217990 734 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nphp4P59240 AC129975.1-201ENSMUST00000224816 592 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nphp4P59240 AC154176.1-201ENSMUST00000225897 220 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nphp4P59240 Gm10020-201ENSMUST00000081993 612 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nphp4P59240 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nphp4P59240 Dcaf12-201ENSMUST00000030145 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nphp4P59240 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nphp4P59240 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nphp4P59240 Gm3642-201ENSMUST00000166895 1762 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nphp4P59240 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nphp4P59240 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nphp4P59240 Ceacam1-205ENSMUST00000206171 1722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nphp4P59240 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nphp4P59240 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nphp4P59240 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nphp4P59240 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nphp4P59240 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nphp4P59240 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nphp4P59240 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nphp4P59240 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nphp4P59240 Gm24791-201ENSMUST00000104284 131 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nphp4P59240 Gm6158-201ENSMUST00000109467 904 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nphp4P59240 Gm16217-201ENSMUST00000124182 616 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nphp4P59240 Gm27191-201ENSMUST00000145973 448 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nphp4P59240 Gm20822-201ENSMUST00000165756 687 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nphp4P59240 Gm20828-201ENSMUST00000170889 687 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nphp4P59240 Gm20781-201ENSMUST00000193154 693 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nphp4P59240 Gm21736-201ENSMUST00000195399 693 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nphp4P59240 C230057A21Rik-202ENSMUST00000195781 600 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nphp4P59240 CT030166.5-201ENSMUST00000222249 420 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nphp4P59240 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nphp4P59240 Olfr525-201ENSMUST00000078103 1050 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nphp4P59240 Gm8325-201ENSMUST00000099086 453 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nphp4P59240 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nphp4P59240 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nphp4P59240 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nphp4P59240 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nphp4P59240 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nphp4P59240 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nphp4P59240 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nphp4P59240 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nphp4P59240 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nphp4P59240 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nphp4P59240 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nphp4P59240 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nphp4P59240 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nphp4P59240 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nphp4P59240 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nphp4P59240 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nphp4P59240 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nphp4P59240 Zfp809-201ENSMUST00000072465 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nphp4P59240 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nphp4P59240 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nphp4P59240 Cenpx-203ENSMUST00000106154 873 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nphp4P59240 Banf2-202ENSMUST00000110032 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nphp4P59240 Ankrd7-202ENSMUST00000115396 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nphp4P59240 Gm5944-201ENSMUST00000118182 1001 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nphp4P59240 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nphp4P59240 Nudt12-203ENSMUST00000174122 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nphp4P59240 Dusp3-207ENSMUST00000176261 496 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nphp4P59240 Platr10-202ENSMUST00000191479 818 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nphp4P59240 Gm45613-201ENSMUST00000210718 443 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nphp4P59240 Banf2-201ENSMUST00000037722 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nphp4P59240 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nphp4P59240 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nphp4P59240 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nphp4P59240 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nphp4P59240 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nphp4P59240 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nphp4P59240 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nphp4P59240 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nphp4P59240 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nphp4P59240 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nphp4P59240 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nphp4P59240 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nphp4P59240 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nphp4P59240 Bcat2-208ENSMUST00000211173 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nphp4P59240 Gm17745-201ENSMUST00000212186 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nphp4P59240 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nphp4P59240 Oma1-201ENSMUST00000035780 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nphp4P59240 Gm5529-201ENSMUST00000165691 891 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nphp4P59240 Gm20414-201ENSMUST00000172918 646 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nphp4P59240 BC028471-201ENSMUST00000200937 520 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nphp4P59240 Gm39397-201ENSMUST00000212331 228 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nphp4P59240 AC154361.2-201ENSMUST00000224747 943 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nphp4P59240 AC159196.1-201ENSMUST00000225524 377 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nphp4P59240 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nphp4P59240 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nphp4P59240 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nphp4P59240 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nphp4P59240 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms