Protein–RNA interactions for Protein: P56481

Cckbr, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CckbrP56481 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CckbrP56481 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CckbrP56481 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CckbrP56481 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CckbrP56481 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
CckbrP56481 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
CckbrP56481 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CckbrP56481 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
CckbrP56481 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
CckbrP56481 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
CckbrP56481 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
CckbrP56481 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
CckbrP56481 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
CckbrP56481 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CckbrP56481 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CckbrP56481 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CckbrP56481 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CckbrP56481 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CckbrP56481 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CckbrP56481 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
CckbrP56481 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CckbrP56481 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CckbrP56481 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CckbrP56481 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CckbrP56481 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
CckbrP56481 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CckbrP56481 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CckbrP56481 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CckbrP56481 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CckbrP56481 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
CckbrP56481 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CckbrP56481 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CckbrP56481 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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