Protein–RNA interactions for Protein: P53811

Pitpnb, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PitpnbP53811 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PitpnbP53811 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PitpnbP53811 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PitpnbP53811 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PitpnbP53811 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
PitpnbP53811 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PitpnbP53811 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PitpnbP53811 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PitpnbP53811 Chrm1-202ENSMUST00000163785 6271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PitpnbP53811 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PitpnbP53811 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PitpnbP53811 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PitpnbP53811 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PitpnbP53811 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PitpnbP53811 Acot9-201ENSMUST00000026324 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PitpnbP53811 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PitpnbP53811 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PitpnbP53811 Gm10912-201ENSMUST00000104891 1661 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PitpnbP53811 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PitpnbP53811 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PitpnbP53811 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PitpnbP53811 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PitpnbP53811 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PitpnbP53811 Pex13-201ENSMUST00000020523 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PitpnbP53811 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PitpnbP53811 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
PitpnbP53811 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PitpnbP53811 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
PitpnbP53811 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PitpnbP53811 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PitpnbP53811 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
PitpnbP53811 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
PitpnbP53811 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PitpnbP53811 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PitpnbP53811 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PitpnbP53811 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PitpnbP53811 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PitpnbP53811 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
PitpnbP53811 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PitpnbP53811 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PitpnbP53811 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PitpnbP53811 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PitpnbP53811 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
PitpnbP53811 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PitpnbP53811 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PitpnbP53811 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PitpnbP53811 Ttll7-205ENSMUST00000170055 6075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PitpnbP53811 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PitpnbP53811 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PitpnbP53811 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PitpnbP53811 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PitpnbP53811 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PitpnbP53811 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PitpnbP53811 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PitpnbP53811 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PitpnbP53811 Dhdds-201ENSMUST00000012262 3133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PitpnbP53811 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PitpnbP53811 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PitpnbP53811 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PitpnbP53811 Ank3-204ENSMUST00000092432 5832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PitpnbP53811 Gm29895-201ENSMUST00000209933 5652 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PitpnbP53811 Mical3-217ENSMUST00000207889 9204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PitpnbP53811 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PitpnbP53811 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PitpnbP53811 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PitpnbP53811 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PitpnbP53811 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PitpnbP53811 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PitpnbP53811 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PitpnbP53811 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PitpnbP53811 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PitpnbP53811 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PitpnbP53811 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PitpnbP53811 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PitpnbP53811 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PitpnbP53811 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PitpnbP53811 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PitpnbP53811 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PitpnbP53811 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
PitpnbP53811 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PitpnbP53811 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PitpnbP53811 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
PitpnbP53811 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
PitpnbP53811 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PitpnbP53811 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PitpnbP53811 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
PitpnbP53811 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PitpnbP53811 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PitpnbP53811 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
PitpnbP53811 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PitpnbP53811 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PitpnbP53811 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PitpnbP53811 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PitpnbP53811 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PitpnbP53811 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PitpnbP53811 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
PitpnbP53811 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PitpnbP53811 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PitpnbP53811 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PitpnbP53811 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms