Protein–RNA interactions for Protein: P52795

Efnb1, Ephrin-B1, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efnb1P52795 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Efnb1P52795 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Efnb1P52795 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Efnb1P52795 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Efnb1P52795 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Efnb1P52795 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Efnb1P52795 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Efnb1P52795 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Efnb1P52795 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Efnb1P52795 Gm44369-201ENSMUST00000204543 2175 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Efnb1P52795 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Efnb1P52795 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Efnb1P52795 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Efnb1P52795 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Efnb1P52795 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Efnb1P52795 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Efnb1P52795 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Efnb1P52795 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Efnb1P52795 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Efnb1P52795 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Efnb1P52795 Apbb1-217ENSMUST00000191011 2712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Efnb1P52795 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Efnb1P52795 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Efnb1P52795 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Efnb1P52795 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Efnb1P52795 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Efnb1P52795 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Efnb1P52795 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Efnb1P52795 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Efnb1P52795 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Efnb1P52795 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Efnb1P52795 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Efnb1P52795 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Efnb1P52795 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Efnb1P52795 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Efnb1P52795 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Efnb1P52795 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Efnb1P52795 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Efnb1P52795 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Efnb1P52795 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Efnb1P52795 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Efnb1P52795 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Efnb1P52795 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Efnb1P52795 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Efnb1P52795 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Efnb1P52795 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Efnb1P52795 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Efnb1P52795 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Efnb1P52795 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Efnb1P52795 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Efnb1P52795 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Efnb1P52795 Pex13-201ENSMUST00000020523 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Efnb1P52795 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Efnb1P52795 Gm31108-201ENSMUST00000204101 1633 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Efnb1P52795 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Efnb1P52795 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Efnb1P52795 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Efnb1P52795 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Efnb1P52795 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Efnb1P52795 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Efnb1P52795 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Efnb1P52795 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Efnb1P52795 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Efnb1P52795 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Efnb1P52795 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Efnb1P52795 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Efnb1P52795 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Efnb1P52795 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Efnb1P52795 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Efnb1P52795 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Efnb1P52795 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Efnb1P52795 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Efnb1P52795 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Efnb1P52795 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Efnb1P52795 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Efnb1P52795 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Efnb1P52795 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Efnb1P52795 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Efnb1P52795 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Efnb1P52795 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Efnb1P52795 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Efnb1P52795 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Efnb1P52795 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Efnb1P52795 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Efnb1P52795 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Efnb1P52795 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Efnb1P52795 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Efnb1P52795 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Efnb1P52795 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Efnb1P52795 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Efnb1P52795 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Efnb1P52795 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Efnb1P52795 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Efnb1P52795 Igkv2-116-201ENSMUST00000199327 362 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Efnb1P52795 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Efnb1P52795 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Efnb1P52795 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Efnb1P52795 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Efnb1P52795 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Efnb1P52795 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms