Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
TspoP50637 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
TspoP50637 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
TspoP50637 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
TspoP50637 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
TspoP50637 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
TspoP50637 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
TspoP50637 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
TspoP50637 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
TspoP50637 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
TspoP50637 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
TspoP50637 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
TspoP50637 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
TspoP50637 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
TspoP50637 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
TspoP50637 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
TspoP50637 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC9.68□□□□□ -0.86
TspoP50637 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC9.68□□□□□ -0.86
TspoP50637 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC9.68□□□□□ -0.86
TspoP50637 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC9.68□□□□□ -0.86
TspoP50637 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC9.68□□□□□ -0.86
TspoP50637 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC9.68□□□□□ -0.86
TspoP50637 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC9.68□□□□□ -0.86
TspoP50637 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
TspoP50637 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC9.68□□□□□ -0.86
TspoP50637 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
TspoP50637 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
TspoP50637 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
TspoP50637 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
TspoP50637 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
TspoP50637 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
TspoP50637 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
TspoP50637 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
TspoP50637 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
TspoP50637 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
TspoP50637 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
TspoP50637 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
TspoP50637 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
TspoP50637 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
TspoP50637 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC9.68□□□□□ -0.86
TspoP50637 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
TspoP50637 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
TspoP50637 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
TspoP50637 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
TspoP50637 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
TspoP50637 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
TspoP50637 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
TspoP50637 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
TspoP50637 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
TspoP50637 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
TspoP50637 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
TspoP50637 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
TspoP50637 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
TspoP50637 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
TspoP50637 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
TspoP50637 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
TspoP50637 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
TspoP50637 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
TspoP50637 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
TspoP50637 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
TspoP50637 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
TspoP50637 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
TspoP50637 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
TspoP50637 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
TspoP50637 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
TspoP50637 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
TspoP50637 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
TspoP50637 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC9.67□□□□□ -0.86
TspoP50637 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
TspoP50637 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.67□□□□□ -0.86
TspoP50637 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC9.67□□□□□ -0.86
TspoP50637 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
TspoP50637 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
TspoP50637 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
TspoP50637 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
TspoP50637 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
TspoP50637 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
TspoP50637 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
TspoP50637 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
TspoP50637 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
TspoP50637 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
TspoP50637 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
TspoP50637 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
TspoP50637 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
TspoP50637 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
TspoP50637 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC9.67□□□□□ -0.86
TspoP50637 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
TspoP50637 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
TspoP50637 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
TspoP50637 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
TspoP50637 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
TspoP50637 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
TspoP50637 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
TspoP50637 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
TspoP50637 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
TspoP50637 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
TspoP50637 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
TspoP50637 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
TspoP50637 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
TspoP50637 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms