Protein–RNA interactions for Protein: P50284

Ltbr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, mousemouse

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbrP50284 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LtbrP50284 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LtbrP50284 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LtbrP50284 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LtbrP50284 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LtbrP50284 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LtbrP50284 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LtbrP50284 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LtbrP50284 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LtbrP50284 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LtbrP50284 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LtbrP50284 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LtbrP50284 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LtbrP50284 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LtbrP50284 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LtbrP50284 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LtbrP50284 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LtbrP50284 Gm6170-201ENSMUST00000187672 1388 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
LtbrP50284 Sec13-201ENSMUST00000032440 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LtbrP50284 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LtbrP50284 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LtbrP50284 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LtbrP50284 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LtbrP50284 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LtbrP50284 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LtbrP50284 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LtbrP50284 Trav13d-1-201ENSMUST00000103588 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LtbrP50284 Smim8-204ENSMUST00000108133 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LtbrP50284 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LtbrP50284 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LtbrP50284 Rbfox1-202ENSMUST00000115841 1191 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LtbrP50284 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
LtbrP50284 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
LtbrP50284 Ndufb5-204ENSMUST00000127477 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LtbrP50284 Mettl5os-201ENSMUST00000129114 667 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LtbrP50284 Gm12069-201ENSMUST00000145127 806 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LtbrP50284 Gm3250-201ENSMUST00000167358 693 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LtbrP50284 Gm3238-201ENSMUST00000168298 693 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LtbrP50284 4732414G09Rik-202ENSMUST00000180695 408 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LtbrP50284 Mir6941-201ENSMUST00000184711 59 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
LtbrP50284 Gm18801-201ENSMUST00000186616 536 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
LtbrP50284 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
LtbrP50284 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
LtbrP50284 Gm44507-201ENSMUST00000206249 343 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LtbrP50284 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LtbrP50284 AC118006.2-201ENSMUST00000224167 962 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
LtbrP50284 Lxn-201ENSMUST00000058981 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LtbrP50284 Uqcc3-201ENSMUST00000096253 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LtbrP50284 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LtbrP50284 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LtbrP50284 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LtbrP50284 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LtbrP50284 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LtbrP50284 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LtbrP50284 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LtbrP50284 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LtbrP50284 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LtbrP50284 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LtbrP50284 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LtbrP50284 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LtbrP50284 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LtbrP50284 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LtbrP50284 Pla2g5-201ENSMUST00000030524 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LtbrP50284 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LtbrP50284 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LtbrP50284 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LtbrP50284 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
LtbrP50284 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LtbrP50284 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LtbrP50284 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LtbrP50284 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LtbrP50284 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LtbrP50284 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LtbrP50284 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LtbrP50284 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LtbrP50284 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LtbrP50284 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LtbrP50284 Eloc-201ENSMUST00000115352 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LtbrP50284 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
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LtbrP50284 Fxyd5-203ENSMUST00000159924 805 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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LtbrP50284 Fxyd5-210ENSMUST00000162116 817 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LtbrP50284 Mc5r-201ENSMUST00000172148 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LtbrP50284 B230110G15Rik-201ENSMUST00000190868 772 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LtbrP50284 Gm37852-201ENSMUST00000193027 350 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
LtbrP50284 Mrpl30-207ENSMUST00000195373 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LtbrP50284 AI839979-201ENSMUST00000200738 654 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LtbrP50284 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
LtbrP50284 Selenos-204ENSMUST00000206044 911 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LtbrP50284 Gm45425-201ENSMUST00000211727 618 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LtbrP50284 4930442G15Rik-201ENSMUST00000213112 1000 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LtbrP50284 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LtbrP50284 Acy1-211ENSMUST00000216400 1030 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LtbrP50284 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LtbrP50284 Olfr1121-201ENSMUST00000062555 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LtbrP50284 Zfp865-202ENSMUST00000076791 1129 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
LtbrP50284 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LtbrP50284 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
LtbrP50284 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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