Protein–RNA interactions for Protein: P49935

Ctsh, Pro-cathepsin H, mousemouse

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Length 333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtshP49935 Nme6-201ENSMUST00000035053 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CtshP49935 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CtshP49935 2310057N15Rik-201ENSMUST00000054223 1028 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CtshP49935 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CtshP49935 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CtshP49935 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
CtshP49935 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CtshP49935 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CtshP49935 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CtshP49935 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CtshP49935 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CtshP49935 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CtshP49935 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CtshP49935 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CtshP49935 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CtshP49935 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CtshP49935 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CtshP49935 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CtshP49935 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CtshP49935 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CtshP49935 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CtshP49935 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CtshP49935 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CtshP49935 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CtshP49935 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CtshP49935 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CtshP49935 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CtshP49935 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CtshP49935 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CtshP49935 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CtshP49935 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CtshP49935 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CtshP49935 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
CtshP49935 Gm21987-201ENSMUST00000119704 456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CtshP49935 Prr3-206ENSMUST00000173585 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CtshP49935 1110036E04Rik-201ENSMUST00000181151 777 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CtshP49935 Gm26989-201ENSMUST00000182608 749 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
CtshP49935 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
CtshP49935 1700109G14Rik-202ENSMUST00000188538 754 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CtshP49935 Mpv17-206ENSMUST00000201353 846 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CtshP49935 Gm6390-201ENSMUST00000215034 589 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
CtshP49935 Gm7525-201ENSMUST00000219425 454 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
CtshP49935 AC123694.1-201ENSMUST00000219525 644 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CtshP49935 CT030166.5-201ENSMUST00000222249 420 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
CtshP49935 AC154361.2-201ENSMUST00000224747 943 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
CtshP49935 C8g-202ENSMUST00000040042 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CtshP49935 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CtshP49935 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CtshP49935 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CtshP49935 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CtshP49935 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CtshP49935 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CtshP49935 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CtshP49935 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
CtshP49935 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
CtshP49935 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtshP49935 Zfp1-202ENSMUST00000211926 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtshP49935 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtshP49935 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtshP49935 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtshP49935 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CtshP49935 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtshP49935 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtshP49935 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtshP49935 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtshP49935 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtshP49935 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtshP49935 Rfc4-202ENSMUST00000115337 416 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtshP49935 Gm9133-201ENSMUST00000118289 540 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CtshP49935 Gm11884-201ENSMUST00000131639 641 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtshP49935 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtshP49935 Gm25830-201ENSMUST00000158923 132 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CtshP49935 Gm24809-201ENSMUST00000175318 271 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CtshP49935 C230057A21Rik-202ENSMUST00000195781 600 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtshP49935 Fkbp6-204ENSMUST00000201791 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtshP49935 Tex29-205ENSMUST00000209692 884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtshP49935 Gm3433-201ENSMUST00000210149 1058 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CtshP49935 AC122024.3-201ENSMUST00000217719 294 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CtshP49935 Id2-203ENSMUST00000222667 958 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CtshP49935 AC130477.1-201ENSMUST00000226982 420 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CtshP49935 Myoz2-201ENSMUST00000029761 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtshP49935 Ctxn2-201ENSMUST00000099452 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtshP49935 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtshP49935 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtshP49935 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtshP49935 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtshP49935 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtshP49935 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtshP49935 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtshP49935 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtshP49935 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtshP49935 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtshP49935 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtshP49935 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtshP49935 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CtshP49935 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtshP49935 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtshP49935 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtshP49935 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtshP49935 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 156.4 ms