Protein–RNA interactions for Protein: P48031

Gbx2, Homeobox protein GBX-2, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx2P48031 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gbx2P48031 Rpap1-201ENSMUST00000048493 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gbx2P48031 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gbx2P48031 Mapkbp1-201ENSMUST00000066058 6942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gbx2P48031 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gbx2P48031 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gbx2P48031 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gbx2P48031 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gbx2P48031 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Gbx2P48031 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gbx2P48031 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gbx2P48031 Abca3-203ENSMUST00000117337 5202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gbx2P48031 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gbx2P48031 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gbx2P48031 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gbx2P48031 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gbx2P48031 Rtl1-201ENSMUST00000149046 6358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gbx2P48031 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gbx2P48031 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Gbx2P48031 Rims1-203ENSMUST00000097809 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gbx2P48031 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gbx2P48031 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gbx2P48031 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gbx2P48031 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gbx2P48031 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gbx2P48031 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gbx2P48031 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gbx2P48031 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gbx2P48031 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gbx2P48031 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gbx2P48031 Pak7-201ENSMUST00000035264 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gbx2P48031 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gbx2P48031 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Gbx2P48031 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gbx2P48031 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gbx2P48031 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gbx2P48031 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gbx2P48031 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gbx2P48031 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gbx2P48031 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gbx2P48031 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Gbx2P48031 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Gbx2P48031 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gbx2P48031 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gbx2P48031 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gbx2P48031 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Gbx2P48031 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gbx2P48031 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gbx2P48031 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gbx2P48031 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Gbx2P48031 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gbx2P48031 Fam234b-201ENSMUST00000111915 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gbx2P48031 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gbx2P48031 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gbx2P48031 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gbx2P48031 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gbx2P48031 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gbx2P48031 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gbx2P48031 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gbx2P48031 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gbx2P48031 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gbx2P48031 Zcchc4-201ENSMUST00000031077 5743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gbx2P48031 Sez6l-205ENSMUST00000212480 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gbx2P48031 Gm20089-201ENSMUST00000192391 2084 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gbx2P48031 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gbx2P48031 Vwa5b2-202ENSMUST00000096197 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gbx2P48031 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gbx2P48031 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gbx2P48031 Gtf3c2-201ENSMUST00000088010 4552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gbx2P48031 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gbx2P48031 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gbx2P48031 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gbx2P48031 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gbx2P48031 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gbx2P48031 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gbx2P48031 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gbx2P48031 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gbx2P48031 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gbx2P48031 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gbx2P48031 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gbx2P48031 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gbx2P48031 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gbx2P48031 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gbx2P48031 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gbx2P48031 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gbx2P48031 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gbx2P48031 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gbx2P48031 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gbx2P48031 Zfp629-203ENSMUST00000122066 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gbx2P48031 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gbx2P48031 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gbx2P48031 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gbx2P48031 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gbx2P48031 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gbx2P48031 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gbx2P48031 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gbx2P48031 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gbx2P48031 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gbx2P48031 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gbx2P48031 Fam186a-202ENSMUST00000100209 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.8 ms