Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Tnfsf13b-203ENSMUST00000207792 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Gm13652-201ENSMUST00000143898 3412 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Slit2-202ENSMUST00000170109 7758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Slit2-217ENSMUST00000174421 7785 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Gimap8-202ENSMUST00000203083 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Ttll5-202ENSMUST00000040273 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Mthfr-201ENSMUST00000069604 6072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Nav2-204ENSMUST00000183659 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Psd-201ENSMUST00000041391 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Psd-202ENSMUST00000096029 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Pnma2-201ENSMUST00000089236 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Olfr1121-202ENSMUST00000213792 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Zfp217-201ENSMUST00000063710 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Prorsd1-202ENSMUST00000133103 2126 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Rnf40-206ENSMUST00000206914 3735 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Zcchc4-201ENSMUST00000031077 5743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Hhip-201ENSMUST00000079038 9074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Fbxl18-202ENSMUST00000110766 7857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Vmn1r16-203ENSMUST00000228356 3492 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Abl2-202ENSMUST00000166172 10151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Gm19040-201ENSMUST00000203280 4726 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Phf21a-202ENSMUST00000068702 6023 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Satb1-207ENSMUST00000140979 3748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Kalrn-202ENSMUST00000089655 6506 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Jmjd4-201ENSMUST00000045279 4315 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Supt16-201ENSMUST00000046709 4673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Atad5-202ENSMUST00000108239 7266 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
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