Protein–RNA interactions for Protein: P40226

Thpo, Thrombopoietin, mousemouse

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThpoP40226 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
ThpoP40226 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
ThpoP40226 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
ThpoP40226 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
ThpoP40226 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC10.9□□□□□ -0.67
ThpoP40226 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.67
ThpoP40226 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.67
ThpoP40226 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.67
ThpoP40226 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
ThpoP40226 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
ThpoP40226 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
ThpoP40226 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.67
ThpoP40226 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
ThpoP40226 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
ThpoP40226 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
ThpoP40226 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
ThpoP40226 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
ThpoP40226 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
ThpoP40226 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
ThpoP40226 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
ThpoP40226 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
ThpoP40226 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
ThpoP40226 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
ThpoP40226 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
ThpoP40226 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
ThpoP40226 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
ThpoP40226 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
ThpoP40226 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
ThpoP40226 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
ThpoP40226 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
ThpoP40226 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
ThpoP40226 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
ThpoP40226 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
ThpoP40226 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
ThpoP40226 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
ThpoP40226 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
ThpoP40226 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
ThpoP40226 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
ThpoP40226 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
ThpoP40226 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
ThpoP40226 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
ThpoP40226 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
ThpoP40226 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
ThpoP40226 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
ThpoP40226 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
ThpoP40226 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
ThpoP40226 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
ThpoP40226 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
ThpoP40226 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
ThpoP40226 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
ThpoP40226 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
ThpoP40226 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
ThpoP40226 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
ThpoP40226 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
ThpoP40226 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
ThpoP40226 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
ThpoP40226 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
ThpoP40226 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
ThpoP40226 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
ThpoP40226 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
ThpoP40226 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
ThpoP40226 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
ThpoP40226 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
ThpoP40226 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
ThpoP40226 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
ThpoP40226 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
ThpoP40226 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
ThpoP40226 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
ThpoP40226 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
ThpoP40226 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
ThpoP40226 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
ThpoP40226 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
ThpoP40226 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
ThpoP40226 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
ThpoP40226 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
ThpoP40226 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
ThpoP40226 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
ThpoP40226 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
ThpoP40226 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
ThpoP40226 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
ThpoP40226 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
ThpoP40226 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
ThpoP40226 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
ThpoP40226 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
ThpoP40226 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
ThpoP40226 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
ThpoP40226 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
ThpoP40226 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
ThpoP40226 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
ThpoP40226 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
ThpoP40226 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
ThpoP40226 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
ThpoP40226 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
ThpoP40226 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
ThpoP40226 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
ThpoP40226 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
ThpoP40226 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
ThpoP40226 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
ThpoP40226 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
ThpoP40226 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 265.8 ms