Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 Gm15839-201ENSMUST00000138684 612 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Chd1P40201 Optc-204ENSMUST00000149380 1180 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Chd1P40201 Gm28809-201ENSMUST00000187542 782 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Chd1P40201 Gm37486-201ENSMUST00000195663 405 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Chd1P40201 Gm42803-201ENSMUST00000201051 451 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Chd1P40201 Gm2716-201ENSMUST00000212350 643 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Chd1P40201 AC151971.6-201ENSMUST00000216193 866 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Chd1P40201 CT025679.1-201ENSMUST00000227106 449 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Chd1P40201 AC161172.1-201ENSMUST00000227801 486 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Chd1P40201 Klra9-201ENSMUST00000071554 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Chd1P40201 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Chd1P40201 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Chd1P40201 Gm13120-201ENSMUST00000117343 1446 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Chd1P40201 Gm13104-201ENSMUST00000119651 1446 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Chd1P40201 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Chd1P40201 Gm45663-201ENSMUST00000210429 1632 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Chd1P40201 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Chd1P40201 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Chd1P40201 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Chd1P40201 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Chd1P40201 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Chd1P40201 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Chd1P40201 Gm23908-201ENSMUST00000104599 132 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Chd1P40201 S100a16-205ENSMUST00000107334 879 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Chd1P40201 Gm14571-201ENSMUST00000118292 570 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Chd1P40201 Gm15132-201ENSMUST00000118581 652 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Chd1P40201 Gm8163-201ENSMUST00000122020 1060 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Chd1P40201 Gm20610-201ENSMUST00000176406 587 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Chd1P40201 Gm2021-201ENSMUST00000190623 464 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Chd1P40201 Gm38135-201ENSMUST00000195068 502 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Chd1P40201 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Chd1P40201 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Chd1P40201 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Chd1P40201 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Chd1P40201 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Chd1P40201 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Chd1P40201 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Chd1P40201 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Chd1P40201 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Chd1P40201 Gm19951-201ENSMUST00000222616 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Chd1P40201 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Chd1P40201 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Chd1P40201 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Chd1P40201 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Chd1P40201 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Chd1P40201 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Chd1P40201 Bgn-207ENSMUST00000169489 1574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Chd1P40201 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Chd1P40201 Gm26021-201ENSMUST00000158664 131 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Chd1P40201 Gm16280-201ENSMUST00000162458 623 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Chd1P40201 B130024G19Rik-204ENSMUST00000191084 634 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Chd1P40201 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Chd1P40201 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Chd1P40201 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Chd1P40201 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Chd1P40201 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Chd1P40201 Reps1-210ENSMUST00000164556 2537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Chd1P40201 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Chd1P40201 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Chd1P40201 Gm38227-201ENSMUST00000193036 1602 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Chd1P40201 Gm20052-201ENSMUST00000200831 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Chd1P40201 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Chd1P40201 Gm28453-201ENSMUST00000185556 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Chd1P40201 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Chd1P40201 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Chd1P40201 Pced1b-204ENSMUST00000228521 1790 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Chd1P40201 Ces2h-201ENSMUST00000172032 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Chd1P40201 Gm43972-201ENSMUST00000181398 1467 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Chd1P40201 Armcx6-201ENSMUST00000052431 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Chd1P40201 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Chd1P40201 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Chd1P40201 Zfp419-201ENSMUST00000173446 916 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Chd1P40201 Trav18-202ENSMUST00000186573 325 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Chd1P40201 Ighv1-8-201ENSMUST00000192236 293 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Chd1P40201 Gm43851-201ENSMUST00000200726 327 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Chd1P40201 Gm19090-201ENSMUST00000218187 774 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Chd1P40201 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Chd1P40201 Dytn-201ENSMUST00000090313 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Chd1P40201 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Chd1P40201 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Chd1P40201 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Chd1P40201 Atp6v0e2-201ENSMUST00000040361 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Chd1P40201 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Chd1P40201 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Chd1P40201 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Chd1P40201 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Chd1P40201 Pmp22-201ENSMUST00000018361 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Chd1P40201 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Chd1P40201 Gm22751-201ENSMUST00000102077 109 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Chd1P40201 Mir692-3-201ENSMUST00000102079 109 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Chd1P40201 Mir692-2-201ENSMUST00000102081 109 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Chd1P40201 Ppih-205ENSMUST00000106321 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Chd1P40201 Gm12688-201ENSMUST00000136525 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Chd1P40201 1700028K03Rik-202ENSMUST00000159902 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Chd1P40201 Gm26812-202ENSMUST00000181776 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Chd1P40201 Gm27200-201ENSMUST00000184626 657 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Chd1P40201 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Chd1P40201 Gm7047-201ENSMUST00000196224 1063 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Chd1P40201 Gm6008-201ENSMUST00000206542 874 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Chd1P40201 Zfp389-202ENSMUST00000224437 1234 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.2 ms