Protein–RNA interactions for Protein: P34928

Apoc1, Apolipoprotein C-I, mousemouse

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Length 88 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc1P34928 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Tiam2-201ENSMUST00000072156 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 C4b-201ENSMUST00000069507 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Dysf-211ENSMUST00000168387 6501 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 AC107453.4-201ENSMUST00000227068 1817 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Zcchc4-201ENSMUST00000031077 5743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Atad5-202ENSMUST00000108239 7266 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Iqce-201ENSMUST00000041783 6037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Kalrn-205ENSMUST00000114953 4722 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Pcdhga7-201ENSMUST00000192511 4730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Scn5a-203ENSMUST00000120420 7536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Kdm3a-202ENSMUST00000167220 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Cbfa2t3-203ENSMUST00000127984 7645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Peg3-201ENSMUST00000051209 8694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Rsph10b-203ENSMUST00000166847 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Fn1-203ENSMUST00000186129 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Slc7a1-201ENSMUST00000048116 7179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Cacna1c-226ENSMUST00000219833 7591 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Gria4-202ENSMUST00000063508 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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