Protein–RNA interactions for Protein: P32043

Hoxc5, Homeobox protein Hox-C5, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc5P32043 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Rhbdf2-202ENSMUST00000103029 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
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