Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

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Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Gm13615-201ENSMUST00000120242 1612 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
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