Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Zfp280b-201ENSMUST00000061617 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Chd7-206ENSMUST00000170391 3462 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Furin-202ENSMUST00000120753 4332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Zfp964-203ENSMUST00000204285 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Tbc1d17-201ENSMUST00000047085 8750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Celf1-205ENSMUST00000111449 4441 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Cyp26b1-205ENSMUST00000205228 4288 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cd28P31041 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cd28P31041 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Tpp2-201ENSMUST00000087933 4649 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Gm19040-201ENSMUST00000203280 4726 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Fbxl18-202ENSMUST00000110766 7857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cd28P31041 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Asb1-201ENSMUST00000027538 5826 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Mon2-201ENSMUST00000037557 5511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Tmem88b-201ENSMUST00000097742 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cd28P31041 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Csgalnact1-201ENSMUST00000078350 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Wdr19-204ENSMUST00000203653 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Nfkbiz-201ENSMUST00000036273 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Clasp2-201ENSMUST00000111838 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Cd28P31041 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cd28P31041 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Cd28P31041 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Cd28P31041 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Abca3-203ENSMUST00000117337 5202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Gm45140-202ENSMUST00000204419 5061 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Ippk-202ENSMUST00000220447 4421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Recql-202ENSMUST00000100832 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Gm28774-201ENSMUST00000187087 1498 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Brat1-203ENSMUST00000110806 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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