Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtprmP28828 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtprmP28828 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtprmP28828 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtprmP28828 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtprmP28828 Slc25a14-208ENSMUST00000177710 1516 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PtprmP28828 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PtprmP28828 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PtprmP28828 Gm12072-201ENSMUST00000118293 715 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PtprmP28828 Prelid3b-203ENSMUST00000120822 622 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PtprmP28828 Gm12254-201ENSMUST00000134617 471 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PtprmP28828 Gm11521-201ENSMUST00000143302 329 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PtprmP28828 Eef1d-217ENSMUST00000151066 704 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PtprmP28828 Fam47e-205ENSMUST00000175974 1016 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PtprmP28828 Gm28499-201ENSMUST00000191576 666 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PtprmP28828 Ift22-204ENSMUST00000200153 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PtprmP28828 Gm44658-201ENSMUST00000207965 637 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PtprmP28828 Gm39147-202ENSMUST00000211730 882 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PtprmP28828 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PtprmP28828 Ormdl2-203ENSMUST00000219215 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PtprmP28828 AC102327.1-201ENSMUST00000226389 742 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PtprmP28828 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PtprmP28828 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PtprmP28828 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PtprmP28828 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PtprmP28828 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PtprmP28828 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PtprmP28828 Gm15984-202ENSMUST00000156466 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PtprmP28828 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PtprmP28828 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PtprmP28828 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PtprmP28828 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PtprmP28828 Plac9b-201ENSMUST00000100809 388 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtprmP28828 Gm24161-201ENSMUST00000104592 130 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PtprmP28828 Gm15489-201ENSMUST00000132811 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtprmP28828 Gm17171-201ENSMUST00000168048 534 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtprmP28828 Gm19246-201ENSMUST00000173599 255 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PtprmP28828 Gm43103-201ENSMUST00000199021 802 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PtprmP28828 Gm8960-201ENSMUST00000219787 788 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PtprmP28828 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtprmP28828 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtprmP28828 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtprmP28828 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtprmP28828 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtprmP28828 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PtprmP28828 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtprmP28828 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtprmP28828 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtprmP28828 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PtprmP28828 Gm15720-201ENSMUST00000117133 282 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PtprmP28828 Gm8754-201ENSMUST00000118391 520 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PtprmP28828 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PtprmP28828 Zfp961-204ENSMUST00000136516 601 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtprmP28828 Gm16552-201ENSMUST00000162348 685 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtprmP28828 Gm17231-201ENSMUST00000163186 645 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtprmP28828 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PtprmP28828 Mir8111-201ENSMUST00000184463 137 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PtprmP28828 Gm21083-201ENSMUST00000188807 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtprmP28828 Gm18504-201ENSMUST00000220917 929 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PtprmP28828 AC124772.3-201ENSMUST00000222535 575 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PtprmP28828 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtprmP28828 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PtprmP28828 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PtprmP28828 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PtprmP28828 4930579F01Rik-201ENSMUST00000012186 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PtprmP28828 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PtprmP28828 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PtprmP28828 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PtprmP28828 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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PtprmP28828 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PtprmP28828 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PtprmP28828 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PtprmP28828 Msl1-202ENSMUST00000037930 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PtprmP28828 Thoc6-202ENSMUST00000095579 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PtprmP28828 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PtprmP28828 Mir704-201ENSMUST00000102106 77 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
PtprmP28828 Ighv5-12-201ENSMUST00000103450 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PtprmP28828 Gm5944-201ENSMUST00000118182 1001 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
PtprmP28828 Gm6881-201ENSMUST00000121811 833 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
PtprmP28828 Gm16013-201ENSMUST00000152249 353 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PtprmP28828 Gm9574-201ENSMUST00000173127 845 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
PtprmP28828 A630023A22Rik-201ENSMUST00000178958 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PtprmP28828 Mir6396-201ENSMUST00000183603 111 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
PtprmP28828 Gm5311-201ENSMUST00000203518 709 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
PtprmP28828 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PtprmP28828 Gm34397-201ENSMUST00000213192 708 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PtprmP28828 AC122824.1-201ENSMUST00000221705 828 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PtprmP28828 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PtprmP28828 1700069L16Rik-201ENSMUST00000047891 537 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PtprmP28828 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PtprmP28828 Gm9869-201ENSMUST00000063858 375 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PtprmP28828 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PtprmP28828 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PtprmP28828 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtprmP28828 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtprmP28828 Gm26908-201ENSMUST00000181856 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtprmP28828 AC151836.1-201ENSMUST00000228730 1637 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PtprmP28828 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtprmP28828 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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