Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RxraP28700 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RxraP28700 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RxraP28700 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RxraP28700 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RxraP28700 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RxraP28700 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RxraP28700 C2cd5-204ENSMUST00000203187 3494 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RxraP28700 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RxraP28700 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RxraP28700 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
RxraP28700 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RxraP28700 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RxraP28700 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
RxraP28700 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RxraP28700 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
RxraP28700 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RxraP28700 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RxraP28700 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
RxraP28700 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RxraP28700 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
RxraP28700 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RxraP28700 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RxraP28700 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
RxraP28700 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
RxraP28700 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RxraP28700 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RxraP28700 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RxraP28700 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RxraP28700 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RxraP28700 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RxraP28700 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
RxraP28700 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
RxraP28700 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RxraP28700 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RxraP28700 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RxraP28700 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
RxraP28700 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
RxraP28700 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RxraP28700 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
RxraP28700 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
RxraP28700 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
RxraP28700 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RxraP28700 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
RxraP28700 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
RxraP28700 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RxraP28700 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
RxraP28700 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
RxraP28700 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
RxraP28700 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
RxraP28700 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
RxraP28700 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
RxraP28700 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
RxraP28700 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RxraP28700 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RxraP28700 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
RxraP28700 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RxraP28700 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RxraP28700 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RxraP28700 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RxraP28700 E030026E10Rik-201ENSMUST00000200395 2217 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
RxraP28700 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RxraP28700 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
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RxraP28700 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
RxraP28700 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RxraP28700 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RxraP28700 Ccdc63-201ENSMUST00000058960 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RxraP28700 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RxraP28700 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RxraP28700 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RxraP28700 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RxraP28700 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RxraP28700 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RxraP28700 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
RxraP28700 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RxraP28700 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RxraP28700 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
RxraP28700 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RxraP28700 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RxraP28700 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
RxraP28700 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RxraP28700 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
RxraP28700 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RxraP28700 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
RxraP28700 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RxraP28700 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
RxraP28700 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RxraP28700 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
RxraP28700 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
RxraP28700 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RxraP28700 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
RxraP28700 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RxraP28700 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
RxraP28700 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
RxraP28700 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
RxraP28700 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
RxraP28700 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
RxraP28700 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
RxraP28700 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
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