Protein–RNA interactions for Protein: P28653

Bgn, Biglycan, mousemouse

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Length 369 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BgnP28653 Pigc-205ENSMUST00000193784 4207 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
BgnP28653 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
BgnP28653 Scn5a-203ENSMUST00000120420 7536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
BgnP28653 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
BgnP28653 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
BgnP28653 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
BgnP28653 Impa1-202ENSMUST00000118410 2988 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
BgnP28653 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
BgnP28653 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
BgnP28653 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
BgnP28653 Hif1an-201ENSMUST00000040455 6194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
BgnP28653 Gm29895-201ENSMUST00000209933 5652 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
BgnP28653 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
BgnP28653 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
BgnP28653 Pcsk9-201ENSMUST00000049507 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
BgnP28653 Nos3-202ENSMUST00000115090 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
BgnP28653 Arhgap24-205ENSMUST00000112853 2853 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
BgnP28653 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
BgnP28653 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
BgnP28653 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
BgnP28653 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
BgnP28653 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
BgnP28653 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
BgnP28653 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
BgnP28653 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
BgnP28653 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
BgnP28653 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
BgnP28653 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
BgnP28653 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
BgnP28653 Zfp366-201ENSMUST00000056558 6382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
BgnP28653 Gm5420-201ENSMUST00000071008 2206 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
BgnP28653 Hpcal4-201ENSMUST00000059667 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
BgnP28653 Dglucy-204ENSMUST00000110073 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
BgnP28653 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
BgnP28653 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
BgnP28653 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
BgnP28653 Pnma2-201ENSMUST00000089236 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
BgnP28653 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
BgnP28653 Ablim2-204ENSMUST00000114204 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
BgnP28653 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
BgnP28653 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
BgnP28653 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
BgnP28653 Trappc9-202ENSMUST00000089770 4047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
BgnP28653 Prom2-202ENSMUST00000103214 4190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
BgnP28653 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
BgnP28653 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
BgnP28653 Tnfsf13b-203ENSMUST00000207792 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
BgnP28653 Tom1l2-204ENSMUST00000095254 4940 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
BgnP28653 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
BgnP28653 Ddr1-201ENSMUST00000003628 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
BgnP28653 Fsd2-201ENSMUST00000042318 3985 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
BgnP28653 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
BgnP28653 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
BgnP28653 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
BgnP28653 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
BgnP28653 Phip-201ENSMUST00000034787 10756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
BgnP28653 Atad5-202ENSMUST00000108239 7266 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
BgnP28653 Plpp3-201ENSMUST00000064139 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
BgnP28653 Xirp1-201ENSMUST00000111635 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
BgnP28653 Dkk2-201ENSMUST00000029665 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
BgnP28653 Fbxl18-202ENSMUST00000110766 7857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
BgnP28653 Phf8-211ENSMUST00000168501 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
BgnP28653 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
BgnP28653 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
BgnP28653 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
BgnP28653 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
BgnP28653 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
BgnP28653 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
BgnP28653 Col19a1-202ENSMUST00000115244 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
BgnP28653 Nfkbiz-201ENSMUST00000036273 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
BgnP28653 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
BgnP28653 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
BgnP28653 Sgsm1-202ENSMUST00000057209 4339 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
BgnP28653 Anxa7-201ENSMUST00000065504 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
BgnP28653 Slc6a2-201ENSMUST00000072939 6187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
BgnP28653 Rnf40-206ENSMUST00000206914 3735 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
BgnP28653 Ndufs1-203ENSMUST00000168099 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
BgnP28653 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
BgnP28653 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
BgnP28653 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
BgnP28653 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
BgnP28653 Prorsd1-202ENSMUST00000133103 2126 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
BgnP28653 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
BgnP28653 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
BgnP28653 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
BgnP28653 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
BgnP28653 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
BgnP28653 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
BgnP28653 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
BgnP28653 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
BgnP28653 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
BgnP28653 Clasp2-201ENSMUST00000111838 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
BgnP28653 Rxfp2-201ENSMUST00000065745 2539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
BgnP28653 Ano10-203ENSMUST00000214409 2384 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
BgnP28653 Tiam2-201ENSMUST00000072156 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
BgnP28653 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
BgnP28653 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
BgnP28653 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
BgnP28653 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
BgnP28653 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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