Protein–RNA interactions for Protein: P28571

Slc6a9, Sodium- and chloride-dependent glycine transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 692 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a9P28571 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Slc6a9P28571 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Slc6a9P28571 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Slc6a9P28571 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Slc6a9P28571 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Slc6a9P28571 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Slc6a9P28571 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Slc6a9P28571 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Slc6a9P28571 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Slc6a9P28571 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Slc6a9P28571 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Slc6a9P28571 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Slc6a9P28571 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Slc6a9P28571 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Slc6a9P28571 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Slc6a9P28571 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Slc6a9P28571 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Slc6a9P28571 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Slc6a9P28571 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Slc6a9P28571 Pml-207ENSMUST00000135310 4413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Slc6a9P28571 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Slc6a9P28571 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Slc6a9P28571 Arhgef7-203ENSMUST00000098938 4628 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Slc6a9P28571 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Slc6a9P28571 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Slc6a9P28571 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Slc6a9P28571 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Slc6a9P28571 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Slc6a9P28571 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Slc6a9P28571 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Slc6a9P28571 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Slc6a9P28571 Slc23a2-201ENSMUST00000028815 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Slc6a9P28571 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Slc6a9P28571 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Slc6a9P28571 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Slc6a9P28571 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Slc6a9P28571 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Slc6a9P28571 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Slc6a9P28571 Kalrn-202ENSMUST00000089655 6506 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Slc6a9P28571 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Slc6a9P28571 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Slc6a9P28571 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Slc6a9P28571 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Slc6a9P28571 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Slc6a9P28571 Myh13-201ENSMUST00000081911 5817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Slc6a9P28571 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Slc6a9P28571 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Slc6a9P28571 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Slc6a9P28571 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Slc6a9P28571 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Slc6a9P28571 Notch2-201ENSMUST00000079812 10500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Slc6a9P28571 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Slc6a9P28571 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Slc6a9P28571 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Slc6a9P28571 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Slc6a9P28571 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Slc6a9P28571 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Slc6a9P28571 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Slc6a9P28571 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Slc6a9P28571 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Slc6a9P28571 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Slc6a9P28571 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Slc6a9P28571 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Slc6a9P28571 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Slc6a9P28571 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Slc6a9P28571 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Slc6a9P28571 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Slc6a9P28571 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Slc6a9P28571 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Slc6a9P28571 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Slc6a9P28571 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Slc6a9P28571 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Slc6a9P28571 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Slc6a9P28571 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Slc6a9P28571 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Slc6a9P28571 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Slc6a9P28571 Iqce-201ENSMUST00000041783 6037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Slc6a9P28571 Nup50-201ENSMUST00000165443 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Slc6a9P28571 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Slc6a9P28571 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Slc6a9P28571 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Slc6a9P28571 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Slc6a9P28571 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Slc6a9P28571 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Slc6a9P28571 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Slc6a9P28571 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Slc6a9P28571 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Slc6a9P28571 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Slc6a9P28571 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Slc6a9P28571 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Slc6a9P28571 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Slc6a9P28571 Zcchc4-201ENSMUST00000031077 5743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Slc6a9P28571 Rin1-208ENSMUST00000225427 4503 ntAPPRIS P2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Slc6a9P28571 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Slc6a9P28571 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Slc6a9P28571 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Slc6a9P28571 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Slc6a9P28571 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Slc6a9P28571 Astn1-205ENSMUST00000193042 7248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Slc6a9P28571 Gtf3c2-201ENSMUST00000088010 4552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms