Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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PdgfraP26618 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
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PdgfraP26618 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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