Protein–RNA interactions for Protein: P20664

Prim1, DNA primase small subunit, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim1P20664 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prim1P20664 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prim1P20664 BB019430-202ENSMUST00000218015 1320 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prim1P20664 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Platr3-201ENSMUST00000146980 412 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prim1P20664 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Gm26609-201ENSMUST00000181302 852 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Gm27039-201ENSMUST00000182438 962 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Prim1P20664 2610001A08Rik-201ENSMUST00000193315 867 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prim1P20664 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prim1P20664 AC126043.1-201ENSMUST00000221304 1141 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Prim1P20664 9430031K09Rik-201ENSMUST00000222913 925 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Gm22005-201ENSMUST00000082795 141 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Gm17229-201ENSMUST00000097355 1138 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prim1P20664 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Gm37891-201ENSMUST00000195585 1326 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Olfr183-202ENSMUST00000206303 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Gm14819-201ENSMUST00000101645 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Gm10486-201ENSMUST00000101647 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Gm14632-201ENSMUST00000101654 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prim1P20664 1700113A16Rik-203ENSMUST00000200006 563 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prim1P20664 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Prim1P20664 6330419E04Rik-201ENSMUST00000203087 1263 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prim1P20664 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Prim1P20664 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Prim1P20664 AC164597.2-201ENSMUST00000226738 603 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Gm10147-201ENSMUST00000075388 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms