Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
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Fcer1aP20489 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
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Fcer1aP20489 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
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Fcer1aP20489 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
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Fcer1aP20489 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Tenm2-208ENSMUST00000163524 8668 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
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