Protein–RNA interactions for Protein: P19426

Nelfe, Negative elongation factor E, mousemouse

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NelfeP19426 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
NelfeP19426 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
NelfeP19426 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
NelfeP19426 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
NelfeP19426 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
NelfeP19426 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
NelfeP19426 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
NelfeP19426 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
NelfeP19426 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
NelfeP19426 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
NelfeP19426 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
NelfeP19426 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
NelfeP19426 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC11.15□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC11.15□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
NelfeP19426 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
NelfeP19426 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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