Protein–RNA interactions for Protein: P18533

Ig heavy chain V region 733, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18533 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18533 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
P18533 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18533 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
P18533 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18533 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18533 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18533 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18533 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18533 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18533 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18533 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18533 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18533 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18533 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18533 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
P18533 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
P18533 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18533 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
P18533 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
P18533 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18533 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
P18533 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
P18533 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
P18533 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18533 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18533 Vmn1r220-201ENSMUST00000072385 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18533 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18533 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18533 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18533 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18533 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18533 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18533 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18533 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18533 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18533 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18533 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18533 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18533 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18533 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18533 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18533 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18533 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18533 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18533 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18533 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18533 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18533 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18533 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
P18533 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
P18533 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18533 1700036A12Rik-202ENSMUST00000190053 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18533 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18533 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18533 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18533 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18533 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18533 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18533 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18533 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18533 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18533 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18533 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18533 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18533 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18533 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18533 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18533 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18533 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
P18533 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18533 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18533 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18533 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18533 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18533 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18533 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
P18533 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18533 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18533 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18533 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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P18533 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18533 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18533 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18533 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18533 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18533 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18533 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18533 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18533 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18533 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18533 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18533 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18533 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18533 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18533 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18533 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18533 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18533 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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