Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Gm20918-202ENSMUST00000188637 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Ccl2-201ENSMUST00000000193 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Gm14005-208ENSMUST00000223654 681 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Dcun1d2-203ENSMUST00000110839 2937 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Lipg-201ENSMUST00000066532 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Rasgef1a-203ENSMUST00000203804 2183 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Scgb2a2-201ENSMUST00000179814 1107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Gm43055-201ENSMUST00000198859 879 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Olfr684-201ENSMUST00000060893 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Gramd1b-213ENSMUST00000211853 2659 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Pdlim5-204ENSMUST00000168967 1755 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Tmem126b-201ENSMUST00000032843 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Tbpl1-202ENSMUST00000127698 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Aco2-201ENSMUST00000023116 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Gm43221-201ENSMUST00000197612 2071 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Diablo-207ENSMUST00000145152 2588 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Tnf-201ENSMUST00000025263 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
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